La dirección de Área de Epidemiología y Sanidad es una unidad técnico-administrativa, dependiente de la Dirección General de Salud Municipal de León, la cual realiza actividades de vigilancia epidemiológica en base a los lineamientos y directrices del ente rector en materia de Salud en el estado, la Secretaría de Salud, esto con el fin de promover y realizar de forma conjunta y autónoma acciones que vayan dirigidos a la prevención, control de enfermedades y promoción de la salud dentro del Municipio de León, Guanajuato.

Esta dirección tiene a su cargo los programas de detección oportuna de cáncer de mama, cáncer cervicouterino y detección de cáncer de próstata. De igual forma, los trabajos de nebulización de dengue y la coordinación del Centro de Control y Bienestar Animal de León.